DRUG BINDING INTERFACES MAPPED TO 'Arabidopsis thaliana'

List of Binding Interfaces
(Click on the entry ID to view details of interfaces and pattern clusters)
(Note that ASSAM search use only 3-12 residue containing patterns)
Filter list by:
DrReposER ID PDB Ligand Organism Macromolecule Pfam Res. Interface HETATM
1U1J_A_C2FA773 1u1j C2F

DB11256
(Levomefolic
acid)
Arabidopsis
thaliana
5-METHYLTETRAHYDROPT
EROYLTRIGLUTAMATE--H
OMOCYSTEINE
METHYLTRANSFERASE
PF01717
(Meth_synt_1)
PF08267
(Meth_synt_2)
8 ARG A  15
LYS A  18
ASN A 116
HIS A 118
SER A 517
ARG A 521
VAL A 523
TRP A 567
C2F A 773
2C2B_A_SAMA500 2c2b SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine)
Arabidopsis
thaliana
THREONINE SYNTHASE
1, CHLOROPLASTIC
None
PF00291
(PALP)
10 SER A  99
TRP A 101
GLY A 104
SER A 105
SER A 125
PHE A 127
ASN B 132
LEU B 133
TRP B 150
GLN B 281
SAM A 500
2C2B_A_SAMA501 2c2b SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine)
Arabidopsis
thaliana
THREONINE SYNTHASE
1, CHLOROPLASTIC
None
PF00291
(PALP)
5 TRP A 101
TRP B 135
LYS B 141
ASN B 147
TRP B 150
SAM A 501
2C2B_B_SAMB500 2c2b SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine)
Arabidopsis
thaliana
THREONINE SYNTHASE
1, CHLOROPLASTIC
None
PF00291
(PALP)
10 SER B  99
TRP B 101
GLY B 104
SER B 105
SER B 125
PHE B 127
ASN A 132
LEU A 133
TRP A 150
GLN A 281
SAM B 500
2C2B_B_SAMB501 2c2b SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine)
Arabidopsis
thaliana
THREONINE SYNTHASE
1, CHLOROPLASTIC
None
PF00291
(PALP)
5 TRP B 101
TRP A 135
LYS A 141
ASN A 147
TRP A 150
SAM B 501
2C2B_C_SAMC500 2c2b SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine)
Arabidopsis
thaliana
THREONINE SYNTHASE
1, CHLOROPLASTIC
None 10 SER C  99
TRP C 101
GLY C 104
SER C 105
SER C 125
PHE C 127
ASN D 132
LEU D 133
TRP D 150
GLN D 281
SAM C 500
2C2B_C_SAMC501 2c2b SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine)
Arabidopsis
thaliana
THREONINE SYNTHASE
1, CHLOROPLASTIC
None 5 TRP C 101
TRP D 135
LYS D 141
ASN D 147
TRP D 150
SAM C 501
2C2B_D_SAMD500 2c2b SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine)
Arabidopsis
thaliana
THREONINE SYNTHASE
1, CHLOROPLASTIC
None 9 TRP D 101
GLY D 104
SER D 105
SER D 125
PHE D 127
ASN C 132
LEU C 133
TRP C 150
GLN C 281
SAM D 500
2C2B_D_SAMD501 2c2b SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine)
Arabidopsis
thaliana
THREONINE SYNTHASE
1, CHLOROPLASTIC
None 5 TRP D 101
TRP C 135
LYS C 141
ASN C 147
TRP C 150
SAM D 501
2C2B_E_SAME500 2c2b SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine)
Arabidopsis
thaliana
THREONINE SYNTHASE
1, CHLOROPLASTIC
None 11 SER E  99
TRP E 101
GLY E 104
SER E 105
SER E 125
PHE E 127
ASN F 132
LEU F 133
TRP F 150
GLN F 281
ASP F 283
SAM E 500
2C2B_E_SAME501 2c2b SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine)
Arabidopsis
thaliana
THREONINE SYNTHASE
1, CHLOROPLASTIC
None 5 TRP E 101
TRP F 135
LYS F 141
ASN F 147
TRP F 150
SAM E 501
2C2B_F_SAMF500 2c2b SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine)
Arabidopsis
thaliana
THREONINE SYNTHASE
1, CHLOROPLASTIC
None 10 SER F  99
TRP F 101
GLY F 104
SER F 105
SER F 125
PHE F 127
ASN E 132
LEU E 133
TRP E 150
GLN E 281
SAM F 500
2C2B_F_SAMF501 2c2b SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine)
Arabidopsis
thaliana
THREONINE SYNTHASE
1, CHLOROPLASTIC
None 6 TRP F 101
TRP E 135
LYS E 141
ASN E 147
TRP E 150
ASN C 376
SAM F 501
2CDQ_A_SAMA1500 2cdq SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine)
Arabidopsis
thaliana
ASPARTOKINASE PF00696
(AA_kinase)
8 ILE A 370
SER A 371
ASP A 387
TRP A 392
SER A 393
ARG A 394
LEU A 396
GLU A 400
SAM A1500
2CDQ_B_SAMB1500 2cdq SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine)
Arabidopsis
thaliana
ASPARTOKINASE None 7 SER B 371
ASP B 387
TRP B 392
SER B 393
ARG B 394
LEU B 396
GLU B 400
SAM B1500
2VTB_B_ACTB1500 2vtb ACT

DB03166
(Acetic
acid)
Arabidopsis
thaliana
CRYPTOCHROME DASH PF00875
(DNA_photolyase)
PF03441
(FAD_binding_7)
4 ARG B 119
PHE B 134
VAL B 223
ASP B 224
ACT B1500
3GAN_A_SVRA158 3gan SVR

DB04786
(Suramin)
Arabidopsis
thaliana
UNCHARACTERIZED
PROTEIN AT3G22680
PF09187
(RdDM_RDM1)
11 ARG A  41
TYR A  48
GLN A  51
VAL A  52
PRO A  53
PRO A  81
TRP A 140
TYR A 146
ILE A 150
ILE A 153
PRO A 155
SVR A 158
4BQF_A_QPSA951 4bqf QPS

DB00284
(Acarbose)
Arabidopsis
thaliana
ALPHA-GLUCAN
PHOSPHORYLASE 2,
CYTOSOLIC
PF00343
(Phosphorylase)
6 MET A 356
GLY A 362
TRP A 363
ARG A 400
GLU A 407
ARG A 411
QPS A 951
4BQF_B_QPSB951 4bqf QPS

DB00284
(Acarbose)
Arabidopsis
thaliana
ALPHA-GLUCAN
PHOSPHORYLASE 2,
CYTOSOLIC
no annotation 8 ARG B 217
MET B 356
TRP B 363
ARG B 400
GLU B 403
GLU B 407
LYS B 410
ARG B 411
QPS B 951
4EQ4_A_SALA601 4eq4 SAL

DB00936
(Salicylic
acid)
Arabidopsis
thaliana
4-SUBSTITUTED
BENZOATES-GLUTAMATE
LIGASE GH3.12
PF03321
(GH3)
7 LEU A 116
TYR A 120
ARG A 123
THR A 161
ILE A 217
THR A 324
GLY A 326
SAL A 601
4EQ4_B_SALB601 4eq4 SAL

DB00936
(Salicylic
acid)
Arabidopsis
thaliana
4-SUBSTITUTED
BENZOATES-GLUTAMATE
LIGASE GH3.12
no annotation 8 LEU B 116
TYR B 120
ARG B 123
THR B 161
ILE B 217
VAL B 299
THR B 324
GLY B 326
SAL B 601
4EQL_A_SALA602 4eql SAL

DB00936
(Salicylic
acid)
Arabidopsis
thaliana
4-SUBSTITUTED
BENZOATES-GLUTAMATE
LIGASE GH3.12
PF03321
(GH3)
7 LEU A 116
TYR A 120
ARG A 123
THR A 161
ILE A 217
THR A 324
GLY A 326
SAL A 602
4EQL_B_SALB602 4eql SAL

DB00936
(Salicylic
acid)
Arabidopsis
thaliana
4-SUBSTITUTED
BENZOATES-GLUTAMATE
LIGASE GH3.12
no annotation 7 LEU B 116
TYR B 120
ARG B 123
THR B 161
ILE B 217
THR B 324
GLY B 326
SAL B 602
4G24_A_ACAA1004 4g24 ACA

DB00513
(Aminocaproic
Acid)
Arabidopsis
thaliana
PENTATRICOPEPTIDE
REPEAT-CONTAINING
PROTEIN AT2G32230,
MITOCHONDRIAL
PF16953
(PRORP)
PF17177
(PPR_long)
6 ALA A 401
ASN A 402
LEU A 405
VAL A 406
ASP A 493
GLU A 494
ACA A1004
4L39_A_SALA602 4l39 SAL

DB00936
(Salicylic
acid)
Arabidopsis
thaliana
4-SUBSTITUTED
BENZOATES-GLUTAMATE
LIGASE GH3.12
PF03321
(GH3)
6 LEU A 116
TYR A 120
ARG A 123
ILE A 217
THR A 324
GLY A 326
SAL A 602
4L39_B_SALB601 4l39 SAL

DB00936
(Salicylic
acid)
Arabidopsis
thaliana
4-SUBSTITUTED
BENZOATES-GLUTAMATE
LIGASE GH3.12
no annotation 7 LEU B 116
TYR B 120
ARG B 123
THR B 161
ILE B 217
THR B 324
GLY B 326
SAL B 601
4O79_B_ASCB303 4o79 ASC

DB00126
(Vitamin
C)
Arabidopsis
thaliana
PROBABLE
TRANSMEMBRANE
ASCORBATE
FERRIREDUCTASE 2
None 6 LYS B  77
LYS B  81
TYR B 140
ARG B 150
ALA B 151
MET B 154
ASC B 303
4O7G_A_ASCA303 4o7g ASC

DB00126
(Vitamin
C)
Arabidopsis
thaliana
PROBABLE
TRANSMEMBRANE
ASCORBATE
FERRIREDUCTASE 2
None
PF03188
(Cytochrom_B561)
7 PHE A 105
HIS A 106
ILE A 111
TYR A 115
PHE A 182
ASN A 186
ARG B 191
ASC A 303
4O7G_B_ASCB303 4o7g ASC

DB00126
(Vitamin
C)
Arabidopsis
thaliana
PROBABLE
TRANSMEMBRANE
ASCORBATE
FERRIREDUCTASE 2
None 6 LYS B  77
LYS B  81
TYR B 140
ARG B 150
ALA B 151
MET B 154
ASC B 303
4O7G_B_ASCB304 4o7g ASC

DB00126
(Vitamin
C)
Arabidopsis
thaliana
PROBABLE
TRANSMEMBRANE
ASCORBATE
FERRIREDUCTASE 2
None 6 PHE B 105
HIS B 106
ILE B 111
TYR B 115
PHE B 182
ASN B 186
ASC B 304
5CSY_B_ACRB601 5csy ACR

DB00284
(Acarbose)
Arabidopsis
thaliana
4-ALPHA-GLUCANOTRANS
FERASE DPE1,
CHLOROPLASTIC/AMYLOP
LASTIC
no annotation 17 TYR B 136
ASP B 329
LEU B 330
PHE B 331
GLN B 336
TRP B 338
ARG B 371
ASP B 373
HIS B 374
GLU B 420
LEU B 422
GLY B 423
PHE B 446
HIS B 456
HIS B 472
ASP B 473
PRO B 539
ACR B 601
5ECK_A_ILEA601 5eck ILE

DB00167
(L-
Isoleucine)
Arabidopsis
thaliana
JASMONIC ACID-AMIDO
SYNTHETASE JAR1
PF03321
(GH3)
6 ALA A 165
THR A 166
VAL A 169
TYR A 170
VAL A 222
HIS A 534
ILE A 601
5ECK_D_ILED601 5eck ILE

DB00167
(L-
Isoleucine)
Arabidopsis
thaliana
JASMONIC ACID-AMIDO
SYNTHETASE JAR1
None 6 ALA D 165
THR D 166
VAL D 169
TYR D 170
VAL D 222
HIS D 534
ILE D 601
5ECL_A_ILEA602 5ecl ILE

DB00167
(L-
Isoleucine)
Arabidopsis
thaliana
JASMONIC ACID-AMIDO
SYNTHETASE JAR1
PF03321
(GH3)
6 ALA A 165
THR A 166
VAL A 169
TYR A 170
VAL A 222
HIS A 534
ILE A 602
5ECL_D_ILED602 5ecl ILE

DB00167
(L-
Isoleucine)
Arabidopsis
thaliana
JASMONIC ACID-AMIDO
SYNTHETASE JAR1
None 6 ILE D 148
ALA D 165
THR D 166
VAL D 169
VAL D 222
HIS D 534
ILE D 602
5ECM_A_LEUA602 5ecm LEU

DB00149
(L-
Leucine)
Arabidopsis
thaliana
JASMONIC ACID-AMIDO
SYNTHETASE JAR1
PF03321
(GH3)
5 THR A 164
ALA A 165
THR A 166
TYR A 170
HIS A 534
LEU A 602
5ECM_D_LEUD602 5ecm LEU

DB00149
(L-
Leucine)
Arabidopsis
thaliana
JASMONIC ACID-AMIDO
SYNTHETASE JAR1
None 7 ALA D 165
THR D 166
VAL D 169
TYR D 170
VAL D 222
GLU D 533
HIS D 534
LEU D 602
5ECN_A_LEUA602 5ecn LEU

DB00149
(L-
Leucine)
Arabidopsis
thaliana
JASMONIC ACID-AMIDO
SYNTHETASE JAR1
PF03321
(GH3)
7 ALA A 165
THR A 166
TYR A 170
VAL A 222
LYS A 530
GLU A 533
HIS A 534
LEU A 602
5ECN_D_LEUD602 5ecn LEU

DB00149
(L-
Leucine)
Arabidopsis
thaliana
JASMONIC ACID-AMIDO
SYNTHETASE JAR1
None 8 ILE D 148
ALA D 165
THR D 166
VAL D 169
TYR D 170
VAL D 222
GLU D 533
HIS D 534
LEU D 602
5ECO_A_LEUA602 5eco LEU

DB00149
(L-
Leucine)
Arabidopsis
thaliana
JASMONIC ACID-AMIDO
SYNTHETASE JAR1
PF03321
(GH3)
6 THR A 164
ALA A 165
THR A 166
VAL A 169
TYR A 170
HIS A 534
LEU A 602
5ECO_D_LEUD602 5eco LEU

DB00149
(L-
Leucine)
Arabidopsis
thaliana
JASMONIC ACID-AMIDO
SYNTHETASE JAR1
None 7 ALA D 165
THR D 166
VAL D 169
TYR D 170
VAL D 222
GLU D 533
HIS D 534
LEU D 602
5EWU_A_BEZA1401 5ewu BEZ

DB03793
(Benzoic
Acid)
Arabidopsis
thaliana
MAGNESIUM-CHELATASE
SUBUNIT CHLH,
CHLOROPLASTIC
PF02514
(CobN-Mg_chel)
6 TRP A1033
GLY A1034
THR A1035
SER A1087
VAL A1089
HIS A1223
BEZ A1401
5EWU_B_BEZB1401 5ewu BEZ

DB03793
(Benzoic
Acid)
Arabidopsis
thaliana
MAGNESIUM-CHELATASE
SUBUNIT CHLH,
CHLOROPLASTIC
None 6 TRP B1033
GLY B1034
THR B1035
SER B1087
VAL B1089
HIS B1223
BEZ B1401
5U6M_A_SALA503 5u6m SAL

DB00936
(Salicylic
acid)
Arabidopsis
thaliana
UDP-GLYCOSYLTRANSFER
ASE 74F2
PF00201
(UDPGT)
7 THR A  15
HIS A  18
PHE A 113
GLN A 134
MET A 183
MET A 274
THR A 365
SAL A 503
5U6M_B_SALB503 5u6m SAL

DB00936
(Salicylic
acid)
Arabidopsis
thaliana
UDP-GLYCOSYLTRANSFER
ASE 74F2
no annotation 7 THR B  15
HIS B  18
PHE B 113
GLN B 134
MET B 183
MET B 274
THR B 365
SAL B 503
5U6N_A_SALA505 5u6n SAL

DB00936
(Salicylic
acid)
Arabidopsis
thaliana
UDP-GLYCOSYLTRANSFER
ASE 74F2
PF00201
(UDPGT)
8 SER A  15
HIS A  18
PHE A 113
GLN A 134
MET A 183
MET A 274
TRP A 364
THR A 365
SAL A 505
5U6N_B_SALB504 5u6n SAL

DB00936
(Salicylic
acid)
Arabidopsis
thaliana
UDP-GLYCOSYLTRANSFER
ASE 74F2
no annotation 6 SER B  15
HIS B  18
PHE B 113
GLN B 134
MET B 274
THR B 365
SAL B 504
6A5K_A_SAMA805 6a5k SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine)
Arabidopsis
thaliana
HISTONE-LYSINE
N-METHYLTRANSFERASE,
H3 LYSINE-9 SPECIFIC
SUVH6
PF00856
(SET)
PF02182
(SAD_SRA)
PF05033
(Pre-SET)
13 ARG A 626
GLY A 627
TRP A 628
GLU A 663
TYR A 664
ASN A 717
HIS A 718
TYR A 759
LYS A 776
CYS A 778
PHE A 779
CYS A 780
LEU A 789
SAM A 805
6A5M_A_SAMA805 6a5m SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine)
Arabidopsis
thaliana
HISTONE-LYSINE
N-METHYLTRANSFERASE,
H3 LYSINE-9 SPECIFIC
SUVH6
PF00856
(SET)
PF02182
(SAD_SRA)
PF05033
(Pre-SET)
13 ARG A 626
GLY A 627
TRP A 628
GLU A 663
TYR A 664
ASN A 717
HIS A 718
TYR A 759
LYS A 776
CYS A 778
PHE A 779
CYS A 780
LEU A 789
SAM A 805
6GB9_A_ACTA508 6gb9 ACT

DB03166
(Acetic
acid)
Arabidopsis
thaliana
MOLYBDOPTERIN
BIOSYNTHESIS PROTEIN
CNX1
PF00994
(MoeA_N)
PF03453
(MoCF_biosynth)
PF03454
(MoeA_C)
3 VAL A 203
ALA A 207
GLN A 214
ACT A 508
6GBF_A_ACTA507 6gbf ACT

DB03166
(Acetic
acid)
Arabidopsis
thaliana
MOLYBDOPTERIN
BIOSYNTHESIS PROTEIN
CNX1
PF00994
(MoeA_N)
PF03453
(MoCF_biosynth)
PF03454
(MoeA_C)
3 LYS A 294
SER A 328
SER A 400
ACT A 507